Protein–RNA interactions for Protein: Q5PR19

Putative UPF0607 protein LOC392364, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5PR19 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5PR19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5PR19 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5PR19 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5PR19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5PR19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5PR19 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5PR19 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5PR19 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5PR19 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5PR19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5PR19 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5PR19 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5PR19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q5PR19 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q5PR19 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q5PR19 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5PR19 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5PR19 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5PR19 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5PR19 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5PR19 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5PR19 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5PR19 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5PR19 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5PR19 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5PR19 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5PR19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5PR19 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5PR19 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5PR19 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms