Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fam208bQ5DTT3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam208bQ5DTT3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms