Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP1Q16831 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms