Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SQLEQ14534 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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