Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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RPA4Q13156 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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RPA4Q13156 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RPA4Q13156 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPA4Q13156 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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