Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Ttc39dQ0VF76 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Ttc39dQ0VF76 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc39dQ0VF76 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Ttc39dQ0VF76 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Ttc39dQ0VF76 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ttc39dQ0VF76 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ttc39dQ0VF76 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ttc39dQ0VF76 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Ttc39dQ0VF76 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Ttc39dQ0VF76 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ttc39dQ0VF76 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ttc39dQ0VF76 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc39dQ0VF76 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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