Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPAQ06546 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms