Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN1Q04323 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms