Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Kcnb1Q03717 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnb1Q03717 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms