Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chl1P70232 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chl1P70232 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chl1P70232 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chl1P70232 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chl1P70232 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chl1P70232 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chl1P70232 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chl1P70232 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chl1P70232 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chl1P70232 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chl1P70232 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chl1P70232 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms