Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3EP60228 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3EP60228 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms