Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFDNP55196 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFDNP55196 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFDNP55196 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFDNP55196 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFDNP55196 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFDNP55196 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFDNP55196 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFDNP55196 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFDNP55196 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFDNP55196 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFDNP55196 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
AFDNP55196 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
AFDNP55196 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFDNP55196 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFDNP55196 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AFDNP55196 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AFDNP55196 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AFDNP55196 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AFDNP55196 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AFDNP55196 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AFDNP55196 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AFDNP55196 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AFDNP55196 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFDNP55196 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFDNP55196 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
AFDNP55196 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFDNP55196 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFDNP55196 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFDNP55196 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFDNP55196 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFDNP55196 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFDNP55196 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFDNP55196 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AFDNP55196 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AFDNP55196 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AFDNP55196 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AFDNP55196 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AFDNP55196 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AFDNP55196 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AFDNP55196 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AFDNP55196 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFDNP55196 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFDNP55196 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFDNP55196 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
AFDNP55196 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFDNP55196 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFDNP55196 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFDNP55196 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFDNP55196 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFDNP55196 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFDNP55196 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFDNP55196 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFDNP55196 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
AFDNP55196 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFDNP55196 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFDNP55196 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
AFDNP55196 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFDNP55196 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
AFDNP55196 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFDNP55196 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFDNP55196 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFDNP55196 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFDNP55196 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFDNP55196 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFDNP55196 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFDNP55196 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFDNP55196 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFDNP55196 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFDNP55196 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AFDNP55196 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AFDNP55196 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AFDNP55196 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AFDNP55196 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AFDNP55196 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AFDNP55196 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AFDNP55196 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
AFDNP55196 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AFDNP55196 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AFDNP55196 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AFDNP55196 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFDNP55196 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFDNP55196 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFDNP55196 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFDNP55196 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFDNP55196 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFDNP55196 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
AFDNP55196 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFDNP55196 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFDNP55196 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AFDNP55196 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AFDNP55196 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AFDNP55196 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AFDNP55196 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AFDNP55196 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AFDNP55196 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AFDNP55196 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AFDNP55196 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AFDNP55196 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFDNP55196 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms