Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl28P41105 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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