Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH1P40692 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH1P40692 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH1P40692 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH1P40692 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH1P40692 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH1P40692 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH1P40692 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MLH1P40692 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MLH1P40692 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MLH1P40692 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MLH1P40692 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH1P40692 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH1P40692 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH1P40692 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH1P40692 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH1P40692 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH1P40692 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH1P40692 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH1P40692 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH1P40692 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH1P40692 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH1P40692 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH1P40692 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH1P40692 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH1P40692 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH1P40692 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH1P40692 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MLH1P40692 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MLH1P40692 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MLH1P40692 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH1P40692 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH1P40692 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH1P40692 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH1P40692 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH1P40692 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH1P40692 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH1P40692 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH1P40692 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH1P40692 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MLH1P40692 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MLH1P40692 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH1P40692 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH1P40692 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH1P40692 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH1P40692 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH1P40692 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH1P40692 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH1P40692 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MLH1P40692 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms