Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 DPH1YIL103W 1278 nt3.43□□□□□ -1.86
DDI1P40087 CDA2YLR308W 939 nt3.43□□□□□ -1.86
DDI1P40087 RUF21RUF21 707 nt3.43□□□□□ -1.86
DDI1P40087 TAF1YGR274C 3201 nt3.43□□□□□ -1.86
DDI1P40087 EMC1YCL045C 2283 nt3.42□□□□□ -1.86
DDI1P40087 AZR1YGR224W 1842 nt3.42□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YDR431WYDR431W 312 nt3.42□□□□□ -1.86
DDI1P40087 VFA1YER128W 612 nt3.42□□□□□ -1.86
DDI1P40087 SDT1YGL224C 843 nt3.42□□□□□ -1.86
DDI1P40087 RAI1YGL246C 1164 nt3.42□□□□□ -1.86
DDI1P40087 COQ5YML110C 924 nt3.42□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YOR186WYOR186W 435 nt3.42□□□□□ -1.86
DDI1P40087 FDH2YPL275W 711 nt3.42□□□□□ -1.86
DDI1P40087 UBP12YJL197W 3765 nt3.42□□□□□ -1.86
DDI1P40087 FAR8YMR029C 1572 nt3.42□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YOL075CYOL075C 3885 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YER147C-AYER147C-A 411 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 BMH1YER177W 804 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 PXR1YGR280C 816 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YPT7YML001W 627 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 SHH3YMR118C 591 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 KIN2YLR096W 3444 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YKL050CYKL050C 2769 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 SEA4YBL104C 3117 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 FKH2YNL068C 2589 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 POL1YNL102W 4407 nt3.41□□□□□ -1.86
DDI1P40087 YMR018WYMR018W 1545 nt3.4□□□□□ -1.86
DDI1P40087 GAT2YMR136W 1683 nt3.4□□□□□ -1.86
DDI1P40087 PCL9YDL179W 915 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 FCF1YDR339C 570 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 PRP3YDR473C 1410 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 ECO1YFR027W 846 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 GTF1YGR102C 552 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 YJL028WYJL028W 336 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 SFH5YJL145W 885 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 VTA1YLR181C 993 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 BMS1YPL217C 3552 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 RTT109YLL002W 1311 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 NAT1YDL040C 2565 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 FLO10YKR102W 3510 nt3.4□□□□□ -1.87
DDI1P40087 UBX5YDR330W 1503 nt3.39□□□□□ -1.87
DDI1P40087 PHM6YDR281C 315 nt3.39□□□□□ -1.87
DDI1P40087 LSM6YDR378C 261 nt3.39□□□□□ -1.87
DDI1P40087 ARD1YHR013C 717 nt3.39□□□□□ -1.87
DDI1P40087 CDC8YJR057W 651 nt3.39□□□□□ -1.87
DDI1P40087 IRC25YLR021W 540 nt3.39□□□□□ -1.87
DDI1P40087 MRPL3YMR024W 1173 nt3.39□□□□□ -1.87
DDI1P40087 AIM39YOL053W 1188 nt3.39□□□□□ -1.87
DDI1P40087 PRS5YOL061W 1491 nt3.39□□□□□ -1.87
DDI1P40087 RCR2YDR003W 633 nt3.38□□□□□ -1.87
DDI1P40087 ENT5YDR153C 1236 nt3.38□□□□□ -1.87
DDI1P40087 YET2YMR040W 483 nt3.38□□□□□ -1.87
DDI1P40087 RIM11YMR139W 1113 nt3.38□□□□□ -1.87
DDI1P40087 TMC1YOR052C 453 nt3.38□□□□□ -1.87
DDI1P40087 SPN1YPR133C 1233 nt3.38□□□□□ -1.87
DDI1P40087 RPS9BYBR189W 588 nt3.38□□□□□ -1.87
DDI1P40087 SMC3YJL074C 3693 nt3.38□□□□□ -1.87
DDI1P40087 ISW2YOR304W 3363 nt3.38□□□□□ -1.87
DDI1P40087 ORC4YPR162C 1590 nt3.38□□□□□ -1.87
DDI1P40087 TED1YIL039W 1422 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 VID27YNL212W 2349 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 KAP95YLR347C 2586 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 YDL228CYDL228C 642 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 YDR282CYDR282C 1245 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 RPS4BYHR203C 786 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 RPS4AYJR145C 786 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 MRP8YKL142W 660 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 MCK1YNL307C 1128 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 SNF8YPL002C 702 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 SUI3YPL237W 858 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 CDC45YLR103C 1953 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 RRN7YJL025W 1545 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 ROD1YOR018W 2514 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 GSC2YGR032W 5688 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 TDA3YHR009C 1572 nt3.37□□□□□ -1.87
DDI1P40087 KIN4YOR233W 2403 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 RDS1YCR106W 2499 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 NUP85YJR042W 2235 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 POL31YJR006W 1464 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 MDN1YLR106C 14733 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 QRI7YDL104C 1224 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 FAP7YDL166C 594 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 AHA1YDR214W 1053 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 RPS8BYER102W 603 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 ERV29YGR284C 933 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 SSO2YMR183C 888 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 RPS8AYBL072C 603 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 DDP1YOR163W 567 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 ERB1YMR049C 2424 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 APN2YBL019W 1563 nt3.36□□□□□ -1.87
DDI1P40087 PRP31YGR091W 1485 nt3.35□□□□□ -1.87
DDI1P40087 PMT6YGR199W 2280 nt3.35□□□□□ -1.87
DDI1P40087 IMD4YML056C 1575 nt3.35□□□□□ -1.87
DDI1P40087 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.6 ms