Protein–RNA interactions for Protein: P35997

RPS27A, 40S ribosomal protein S27-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS27AP35997 DDI3YNL335W 678 nt2.56□□□□□ -2
RPS27AP35997 YPL107WYPL107W 747 nt2.56□□□□□ -2
RPS27AP35997 PRS5YOL061W 1491 nt2.56□□□□□ -2
RPS27AP35997 DHH1YDL160C 1521 nt2.56□□□□□ -2
RPS27AP35997 ULP1YPL020C 1866 nt2.56□□□□□ -2
RPS27AP35997 YPL216WYPL216W 3309 nt2.55□□□□□ -2
RPS27AP35997 YPP1YGR198W 2454 nt2.55□□□□□ -2
RPS27AP35997 ARC15YIL062C 465 nt2.55□□□□□ -2
RPS27AP35997 SEA4YBL104C 3117 nt2.55□□□□□ -2
RPS27AP35997 YOR385WYOR385W 873 nt2.55□□□□□ -2
RPS27AP35997 YPL276WYPL276W 438 nt2.55□□□□□ -2
RPS27AP35997 MRPS9YBR146W 837 nt2.55□□□□□ -2
RPS27AP35997 YCL022CYCL022C 516 nt2.55□□□□□ -2
RPS27AP35997 TCO89YPL180W 2400 nt2.54□□□□□ -2
RPS27AP35997 RSE1YML049C 4086 nt2.54□□□□□ -2
RPS27AP35997 ROK1YGL171W 1695 nt2.54□□□□□ -2
RPS27AP35997 RPS16BYDL083C 432 nt2.54□□□□□ -2
RPS27AP35997 YGL082WYGL082W 1146 nt2.54□□□□□ -2
RPS27AP35997 YGR269WYGR269W 327 nt2.54□□□□□ -2
RPS27AP35997 YKR073CYKR073C 321 nt2.54□□□□□ -2
RPS27AP35997 RPL20BYOR312C 519 nt2.54□□□□□ -2
RPS27AP35997 HBT1YDL223C 3141 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 RNT1YMR239C 1416 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 GEM1YAL048C 1989 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 USE1YGL098W 738 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 TOM20YGR082W 552 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 YAR069CYAR069C 294 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 RRP36YOR287C 903 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 NAT3YPR131C 588 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 Q0010Q0010 387 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 DYN1YKR054C 12279 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 PRP22YER013W 3438 nt2.53□□□□□ -2
RPS27AP35997 HOS3YPL116W 2094 nt2.53□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 ATG7YHR171W 1893 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 BUD4YJR092W 4344 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 RAD55YDR076W 1221 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YDR491CYDR491C 492 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 RRT13YER066W 558 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 SCM4YGR049W 564 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YJR020WYJR020W 333 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YKR033CYKR033C 426 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 SED5YLR026C 1023 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 JIP3YLR331C 378 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YHR078WYHR078W 1659 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 EMP70YLR083C 2004 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 ERG11YHR007C 1593 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 HEF3YNL014W 3135 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 GYP7YDL234C 2241 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 DEF1YKL054C 2217 nt2.52□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 MDM30YLR368W 1797 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 DPB2YPR175W 2070 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YNL013CYNL013C 378 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YPL014WYPL014W 1146 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YPL041CYPL041C 624 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YBR116CYBR116C 528 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 MEF2YJL102W 2460 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 CHS3YBR023C 3498 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 VPS45YGL095C 1734 nt2.51□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YPL150WYPL150W 2706 nt2.5□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 ORC6YHR118C 1308 nt2.5□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 MCM4YPR019W 2802 nt2.5□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 snR70snR70 164 nt2.5□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 SEC14YMR079W 915 nt2.5□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 REX4YOL080C 870 nt2.5□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 MCA1YOR197W 1299 nt2.5□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 NAT5YOR253W 531 nt2.5□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 ARR1YPR199C 885 nt2.5□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 SLP1YOR154W 1764 nt2.5□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 TSC11YER093C 4293 nt2.5□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 VPS33YLR396C 2076 nt2.49□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 CEP3YMR168C 1827 nt2.49□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YKL050CYKL050C 2769 nt2.49□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 TDA8YAL064C-A 381 nt2.49□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 TIS11YLR136C 858 nt2.49□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 PPA2YMR267W 933 nt2.49□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 SSE2YBR169C 2082 nt2.49□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 MPP10YJR002W 1782 nt2.49□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 UBP14YBR058C 2346 nt2.48□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 RTA1YGR213C 954 nt2.48□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 DCS1YLR270W 1053 nt2.48□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YOR186WYOR186W 435 nt2.48□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 BUB1YGR188C 3066 nt2.48□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 STP2YHR006W 1626 nt2.48□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 AYT1YLL063C 1425 nt2.48□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 DNA2YHR164C 4569 nt2.48□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 ATG13YPR185W 2217 nt2.48□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 BPT1YLL015W 4680 nt2.47□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.47□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 MEF1YLR069C 2286 nt2.47□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 MKC7YDR144C 1791 nt2.47□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 SBE2YDR351W 2595 nt2.47□□□□□ -2.01
RPS27AP35997 TCB2YNL087W 3537 nt2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.1 ms