Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDXP35241 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDXP35241 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDXP35241 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDXP35241 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDXP35241 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDXP35241 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDXP35241 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDXP35241 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDXP35241 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDXP35241 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDXP35241 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RDXP35241 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDXP35241 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDXP35241 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDXP35241 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDXP35241 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDXP35241 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RDXP35241 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDXP35241 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RDXP35241 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDXP35241 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDXP35241 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDXP35241 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDXP35241 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDXP35241 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RDXP35241 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RDXP35241 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDXP35241 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDXP35241 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDXP35241 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RDXP35241 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDXP35241 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDXP35241 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDXP35241 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDXP35241 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms