Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC13P31276 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms