Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLDCP23378 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLDCP23378 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLDCP23378 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLDCP23378 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLDCP23378 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLDCP23378 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLDCP23378 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLDCP23378 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLDCP23378 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLDCP23378 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLDCP23378 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLDCP23378 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLDCP23378 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLDCP23378 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLDCP23378 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLDCP23378 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLDCP23378 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GLDCP23378 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLDCP23378 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLDCP23378 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLDCP23378 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLDCP23378 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLDCP23378 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLDCP23378 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLDCP23378 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLDCP23378 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLDCP23378 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLDCP23378 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLDCP23378 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLDCP23378 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLDCP23378 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLDCP23378 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLDCP23378 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLDCP23378 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLDCP23378 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLDCP23378 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLDCP23378 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLDCP23378 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLDCP23378 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLDCP23378 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLDCP23378 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLDCP23378 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLDCP23378 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLDCP23378 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLDCP23378 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLDCP23378 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLDCP23378 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLDCP23378 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLDCP23378 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GLDCP23378 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GLDCP23378 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms