Protein–RNA interactions for Protein: P23248

RPS1B, 40S ribosomal protein S1-B, yeast

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	P23248	tL(CAA)D	tL(CAA)D	82 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tL(CAA)G1	tL(CAA)G1	82 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	SUP54	tL(CAA)G2	82 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tL(CAA)G3	tL(CAA)G3	82 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	ERJ5	YFR041C	888 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	RPL30	YGL030W	318 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	YMR084W	YMR084W	789 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	YNL013C	YNL013C	378 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	CMD1	YBR109C	444 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	AKR1	YDR264C	2295 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	FLO5	YHR211W	3228 nt		3.05	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	ARP4	YJL081C	1470 nt		3.04	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	KTR6	YPL053C	1341 nt		3.04	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	YGL082W	YGL082W	1146 nt		3.04	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	SPC34	YKR037C	888 nt		3.04	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	CDC73	YLR418C	1182 nt		3.04	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	VAM10	YOR068C	345 nt		3.04	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	YBR134W	YBR134W	402 nt		3.04	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	PFK26	YIL107C	2484 nt		3.04	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	SIZ1	YDR409W	2715 nt		3.04	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	YSP2	YDR326C	4317 nt		3.04	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	UBP10	YNL186W	2379 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	YNR063W	YNR063W	1824 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	CMK1	YFR014C	1341 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	VTC4	YJL012C	2166 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	UBC6	YER100W	753 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	RAI1	YGL246C	1164 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	GTF1	YGR102C	552 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	AIM26	YKL037W	357 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	RPL17A	YKL180W	555 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	RPS0B	YLR048W	759 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	RPS28B	YLR264W	204 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	VPS21	YOR089C	633 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	ELC1	YPL046C	300 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	MET10	YFR030W	3108 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	YMR317W	YMR317W	3423 nt		3.03	□□□□□ -1.92
RPS1B	P23248	SPO1	YNL012W	1896 nt		3.03	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	CSR2	YPR030W	3366 nt		3.02	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	TCP1	YDR212W	1680 nt		3.02	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	RPN1	YHR027C	2982 nt		3.02	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	SET1	YHR119W	3243 nt		3.02	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	RRP17	YDR412W	708 nt		3.02	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	YHR145C	YHR145C	357 nt		3.02	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	MRPL51	YPR100W	423 nt		3.02	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	TMA108	YIL137C	2841 nt		3.02	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	CIN8	YEL061C	3003 nt		3.01	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	RGP1	YDR137W	1992 nt		3.01	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	TGL3	YMR313C	1929 nt		3.01	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	LCB5	YLR260W	2064 nt		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	PCI8	YIL071C	1335 nt		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	DRS2	YAL026C	4068 nt		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	PET54	YGR222W	882 nt		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	YHI9	YHR029C	885 nt		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	BET1	YIL004C	429 nt		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	PRX1	YBL064C	786 nt		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	IST1	YNL265C	897 nt		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	NIP7	YPL211W	546 nt		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	OPY1	YBR129C	987 nt		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	YHR080C	YHR080C	4038 nt		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	MNR2	YKL064W	2910 nt		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	MDM38	YOL027C	1722 nt		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	THI22	YPR121W	1719 nt		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	TFB2	YPL122C	1542 nt		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	CAF130	YGR134W	3369 nt		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	ALE1	YOR175C	1860 nt		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	RPS18A	YDR450W	441 nt		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	FMP32	YFL046W	624 nt		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	OSW5	YMR148W	447 nt		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	MET16	YPR167C	786 nt		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	YDL180W	YDL180W	1644 nt		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	HST1	YOL068C	1512 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	YRB30	YGL164C	1323 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	FAR1	YJL157C	2493 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	SLM2	YNL047C	1971 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	DOA4	YDR069C	2781 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	MAL12	YGR292W	1755 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	MAL32	YBR299W	1755 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	VPS33	YLR396C	2076 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	SSE2	YBR169C	2082 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	YHP1	YDR451C	1062 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	MBR1	YKL093W	1020 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	FAS1	YKL182W	6156 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	ENA2	YDR039C	3276 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	ENA1	YDR040C	3276 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	CHO2	YGR157W	2610 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	CPA2	YJR109C	3357 nt		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	TDA1	YMR291W	1761 nt		2.97	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	RAD5	YLR032W	3510 nt		2.97	□□□□□ -1.93
RPS1B	P23248	LAP2	YNL045W	2016 nt		2.97	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.7 ms