Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGFR3P22607 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR3P22607 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms