Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms