Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COX6A1P12074 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX6A1P12074 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1149.2 ms