Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB1P11230 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms