Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALM3P0DP25 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALM3P0DP25 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms