Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApoeP08226 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApoeP08226 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ApoeP08226 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApoeP08226 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApoeP08226 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApoeP08226 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms