Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYBBP04839 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYBBP04839 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYBBP04839 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYBBP04839 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYBBP04839 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYBBP04839 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYBBP04839 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms