Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04213 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04213 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04213 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04213 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04213 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04213 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04213 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04213 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04213 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04213 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P04213 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P04213 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04213 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04213 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P04213 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P04213 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P04213 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P04213 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P04213 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P04213 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04213 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04213 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04213 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04213 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04213 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04213 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04213 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04213 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04213 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04213 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04213 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04213 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04213 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms