Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tgfb1P04202 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgfb1P04202 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.4 ms