Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNB1P01574 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms