Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP56O00567 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP56O00567 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP56O00567 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP56O00567 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP56O00567 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP56O00567 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP56O00567 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP56O00567 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOP56O00567 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP56O00567 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP56O00567 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP56O00567 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP56O00567 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOP56O00567 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP56O00567 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP56O00567 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP56O00567 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP56O00567 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP56O00567 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOP56O00567 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOP56O00567 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOP56O00567 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP56O00567 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP56O00567 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP56O00567 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOP56O00567 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP56O00567 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP56O00567 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP56O00567 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP56O00567 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP56O00567 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP56O00567 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP56O00567 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP56O00567 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOP56O00567 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP56O00567 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP56O00567 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP56O00567 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP56O00567 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP56O00567 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP56O00567 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP56O00567 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP56O00567 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP56O00567 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOP56O00567 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOP56O00567 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NOP56O00567 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NOP56O00567 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP56O00567 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP56O00567 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NOP56O00567 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms