Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm20939L7N243 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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