Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP99D6REC4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP99D6REC4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.8 ms