Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms