Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BC048679D3YXE9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC048679D3YXE9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms