Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NhsB1AV60 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NhsB1AV60 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NhsB1AV60 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms