Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms