Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms