Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37CA5D8V6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37CA5D8V6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms