Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttll9A2APC3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttll9A2APC3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms