Protein–RNA interactions for Protein: S4R2D1

Gm5493, Predicted gene 5493, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5493S4R2D1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5493S4R2D1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5493S4R2D1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5493S4R2D1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5493S4R2D1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5493S4R2D1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5493S4R2D1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms