Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNPO3Q9Y5L0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms