Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IGSF9BQ9UPX0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGSF9BQ9UPX0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms