Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CEP164Q9UPV0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CEP164Q9UPV0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CEP164Q9UPV0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms