Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHF8Q9UPP1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms