Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms