Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF490Q9ULM2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms