Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms