Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSRAQ9UJ68 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSRAQ9UJ68 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms