Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1BQ9UEU0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms